全院共设立9个部门，分别是2个后勤部门：办公室和政治部； 6个业务部门：第一检察部主要负责普通刑事案件，第二检察部主要负责重大刑事案件、经济类型案件以及职务犯罪案件，第三检察部主要负责刑事执行检察工作，第四检察部主要负责民事、行政、生态以及公益诉讼检察工作，第五检察部主要负责未成年人检察工作，综合业务部主要负责案件管理、法律研究、控告、申诉等工作；设有1个直属机构：司法警察大队，负责机关安全保卫等工作。